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新北市住宅及都市更新中心的組織架構如下：
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董監事會
└── 監督整體運作 -
董事長
└── 領導中心政策與方針 -
執行長
└── 負責執行業務與日常運作 -
副執行長
└── 協助執行長處理各項事務 -
下轄四大部門：
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資產管理部
‧ 包租代管組
‧ 社宅組 -
綜合業務一部
‧ 專案組
‧ 企劃組 -
綜合業務二部
‧ 業務組
‧ 企劃宣導組 -
行政部
‧ 行政管理組
‧ 財務組
‧ 法務室
‧ 資訊室
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稽核單位獨立設置，直接對董監事會負責。